「观测数据学相关,干预数据学因果」——数据军备赛已全面转向大规模扰动数据。
1 亿细胞 × 1100 药物 × 50 细胞系,CC0 开源、数月下载近 10 万次;正迈向 10 亿细胞专有数据集(单一合作伙伴模式)。
汇集超 3.5 亿细胞,含 Tahoe-100M 与 AI 策展的 scBaseCamp(2.3 亿细胞、21 物种、72 组织)。
联合 10x Genomics 与 Ultima 生产 10 亿细胞扰动数据;与 NVIDIA 合作 PB 级 GPU 加速;CZI 五年 5 亿美元承诺。
Xaira 自建扰动图谱:2560 万细胞、16 种生物背景的全基因组 CRISPRi Perturb-seq,X-Cell 模型的训练基座。
首个全基因组 CRISPRi Perturb-seq(>250 万细胞),K562/RPE1 数据成为扰动预测模型事实标准评测集。
Tahoe 2026-06 发布的约 200 万细胞表型 + 转录组联合数据集,配套 Rhaister 扰动响应模型。
Arc Institute 主办,对标 CASP。2025 首届:预测 H1 人胚胎干细胞 300 个 CRISPRi 扰动响应,指标 DES / PDS / MAE;114 国 1200+ 团队,计划每年举办。
衡量模型扰动知识推理能力的问答基准;CZI 推理模型 rbio1 达 F1 0.74–0.79,超越 SUMMER 等基线。
Arc 随 STATE 发布的生物学导向评估框架,强调以生物学家关心的指标(差异基因、通路)而非纯统计指标评判模型。
EMBL 团队的基准设计:任何扰动预测模型必须先证明优于「预测训练集均值」与简单可加线性模型——目前无模型在所有指标上稳定达标。
Microsoft Research 团队的严格零样本协议:Geneformer / scGPT 在聚类与批次校正上常不如高变基因 + scVI / Harmony 传统流程。
Arc CTO David Burke:扰动预测准确率约 75% 才能让生物学家免于湿实验验证;当前 STATE 约 40–60%——"阈值在接近但尚未到达"。